A partir da data do pagamento, a empresa tem até 5 dias úteis para pedir a exclusão da dívida. Se você pagou por boleto, deve adicionar 3 dias nesse prazo, que é o tempo de compensação do boleto.
Se esse prazo já passou e a dívida ainda está no aplicativo ou site da Serasa, siga o passo a passo desse conteúdo: https://ajuda.serasa.com.br/hc/pt-br/articles/360000203211-Paguei-o-boleto-do-acordo-no-Limpa-Nome-mas-o-site-n%C3%A3o-atualizou-O-que-fazer